SIBO - symptômes, causes et prise en charge
Le SIBO, pour Small Intestinal Bacterial Overgrowth, correspond à une prolifération excessive de bactéries dans l’intestin grêle. Cette partie du tube digestif contient naturellement beaucoup moins de micro-organismes que le côlon.
Lorsque certaines bactéries y sont présentes en quantité excessive, elles peuvent fermenter précocement une partie des aliments consommés et produire des gaz, notamment de l’hydrogène. Cette fermentation peut contribuer à l’apparition de différents symptômes digestifs.
Ballonnements importants après les repas, ventre gonflé, gaz, douleurs abdominales, diarrhée ou constipation peuvent parfois être associés à un SIBO.
Cependant, ces symptômes ne sont pas spécifiques et peuvent avoir de nombreuses autres causes. Un SIBO ne peut donc pas être diagnostiqué uniquement sur la base des symptômes.
Quels sont les symptômes du SIBO ?
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ballonnements, souvent marqués après les repas, distension abdominale
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reflux gastro-oesophagien
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gaz et/ou flatulences
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douleurs ou crampes abdominales, gastrite
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sensation de digestion difficile, inconfort ou lourdeur après les repas (gastroparésie)
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nausées
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diarrhée, constipation ou alternance du transit
Lorsque la prolifération bactérienne est importante ou persiste dans le temps, elle peut également interférer avec notre digestion et notre assimilation, abîmer la paroi de l'intestin et perturber l’absorption de certains nutriments en favorisant des carences nutritionnelles, une perte de poids ou une fatigue.
Chez certaines personnes, le SIBO peut s’accompagner d’une malabsorption, de modifications de la barrière intestinale ou coexister avec un syndrome de l’intestin irritable. Des manifestations plus générales peuvent également être rapportées, telles que fatigue, brouillard mental, anxiété ou dépression, sensibilités alimentaires, troubles cutanés, céphalées ou douleurs articulaires. Ces symptômes restent toutefois non spécifiques et peuvent avoir de nombreuses autres causes.
Pourquoi un SIBO peut-il se développer ?
Le SIBO n’a pas une cause unique.
Il apparaît généralement lorsqu’un ou plusieurs mécanismes qui permettent normalement de limiter la prolifération bactérienne dans l’intestin grêle sont perturbés.
Causes possibles d'une prolifération bactérienne
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un ralentissement de la motricité intestinale (complex moteur migrant)
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des modifications anatomiques de l'intestin (adhérences, rétrécissement, compression)
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Hypochlorhydrie
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déficience en bile ou enzymes
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Immunodéficience
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Certaines maladies digestives ou métaboliques
La recherche d’un facteur sous-jacent est donc importante.
SIBO à hydrogène, à méthane ou sulfure d'hydrogène?
On entend fréquemment parler de « SIBO hydrogène » et de « SIBO méthane », plus rarement à sulfure d'hydrogène.
Il existe cependant une nuance importante.
SIBO à hydrogène
Une production précoce et importante d’hydrogène (H₂) lors d’un test respiratoire peut être compatible avec une prolifération bactérienne de l’intestin grêle. Ce profil est plus fréquemment associé à un transit accéléré ou à des diarrhées, même si cette association n’est pas systématique.
IMO et méthane
Lorsque le méthane (CH₄) est élevé, on parle aujourd’hui plutôt d’IMO – Intestinal Methanogen Overgrowth, ou prolifération intestinale de micro-organismes méthanogènes. En effet, le méthane n’est pas principalement produit par des bactéries mais par des micro-organismes appelés archées, qui peuvent être présents aussi bien dans l’intestin grêle que dans le côlon. Une production importante de méthane est notamment associée à un ralentissement du transit et à la constipation.
SIBO à hydrogène sulfureux
Cas particulier avec prolifération de sulfure d'hydrogène due à des perturbations des voies métaboliques du souffre: - Exposition aux toxiques - Excès d'entrée aux sulfates - Génétique - Excès d’activité des bactéries sulfato-réductases Signes pouvant être associés: - diarrhée ou constipation - douleurs articulaires - fibromyalgie - irritation de la vessie - paresthésies - fatigue et brouillard mental - Problèmes cutanés
Comment diagnostique-t-on un SIBO ?
Les symptômes seuls ne permettent pas d’établir le diagnostic.
Test des gaz expirés
Le test respiratoire au glucose ou au lactulose est aujourd’hui l’un des examens non invasifs les plus utilisés. Après ingestion du substrat, plusieurs prélèvements d’air expiré sont effectués afin de mesurer notamment : l’hydrogène (H₂) ;le méthane (CH₄).La production de ces gaz au cours du test permet d’évaluer indirectement l’activité fermentaire intestinale. Les critères d’interprétation et le choix entre glucose et lactulose peuvent varier selon les recommandations. Ces tests restent des méthodes indirectes qui doivent être interprétées dans leur contexte clinique.Un résultat positif ne devrait donc jamais être interprété isolément : les symptômes, les antécédents et les facteurs susceptibles d’expliquer le SIBO doivent également être pris en compte.
Le test du SIBO peut se faire à votre domicile grâce à un kit que vous pouvez commander. Les résultats obtenus après analyse dans un laboratoire partenaire peuvent être interprétés au cabinet. Selon les résultats, une coordination avec votre médecin traitant ou gastro-entérologue peuvent être envisagée pour adapter la prise en charge.
Quand suspecter un SIBO ?
En cas de symptômes:
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d'un colon irritable
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de ballonnements
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de reflux gastro-oesophagien
En cas de carence:
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en fer (sans autre cause expliquée)
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en micro nutritment (vitamine B12, minéraux) - souvent baisse de la vit. B12 avec augmentation de l’acide folique
Lors de malabsorption:
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des graisses (stéatorrhées, carence en vitamines A,D,E,K)
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de protéines (albumine, pré albumine) plutôt rare
Quand les symptômes se développent après:
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une gastro-entérite aiguë
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la prise d’IPP, d’opiacés ou d’antibiotiques
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une chirurgie abdominale
Quand ces situations aggravent ou améliore votre condition:
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les antibiotiques amènent une amélioration nette et temporaire
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la prise de prébiotiques ou de probiotiques aggravent les symptômes
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les fibres augmentent la constipation ou d’autres symptômes
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une diète sans gluten aggrave les symptômes ou améliore peu les symptômes d’une maladie coeliaque
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les glucides augmentent les symptômes
Accompagnement par Osmose-Naturopathie
Au cabinet Osmose Naturopathie à Lonay, j’accompagne les personnes présentant des troubles digestifs persistants, notamment des ballonnements, gaz, troubles du transit ou un SIBO diagnostiqué, dans le cadre d’une approche globale et individualisée.
L’accompagnement naturopathique vient en complément du suivi médical, avec pour objectif de mieux comprendre les facteurs alimentaires, digestifs, métaboliques et liés au mode de vie pouvant participer aux symptômes.
Quelle prise en charge en cas de SIBO ?
La prise en charge médicale repose notamment sur certains antibiotiques et constituent actuellement le traitement le plus utilisé du SIBO.
Ma prise en charge naturopathique
Lorsque le diagnostic de SIBO est posé ou qu’une exploration médicale est en cours, l’accompagnement naturopathique peut intervenir en complément du suivi médical.
L’objectif est notamment d’identifier les facteurs susceptibles d’entretenir l’inconfort digestif et de travailler de manière individualisée sur :
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l’alimentation et la tolérance digestive
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le rythme et la composition des repas
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le transit et la motricité digestive
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l’équilibre du microbiote
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les éventuelles carences nutritionnelles
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le sommeil et l’hygiène de vie
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le stress et l’axe intestin-cerveau
L’alimentation peut contribuer à réduire certains symptômes, notamment les ballonnements et les fermentations.
Selon la situation, une adaptation temporaire des glucides fermentescibles ou des FODMAP peut être envisagée.
En phytothérapie, différentes plantes à propriétés antimicrobiennes sont également utilisées dans certaines approches du SIBO. Les compléments alimentaires peuvent éventuellement être intégrés lorsqu’ils sont adaptés à la situation individuelle, en tenant compte des contre-indications, des traitements médicamenteux et du suivi médical.
L’objectif n’est pas simplement de faire disparaître les bactéries, mais de comprendre les facteurs qui ont favorisé leur prolifération et qui peuvent contribuer aux récidives.
FAQ sur le SIBO
Rédigé par Aude Passeraub, naturopathe diplômée en médecine traditionnelle européenne (MTE)
Dernière mise à jour : octobre 2026